MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005838	CCTA	2	8	296	303	25 %	25 %	0 %	50 %	46255072
2	NC_005838	AGGCC	2	10	330	339	20 %	0 %	40 %	40 %	46255072
3	NC_005838	GAG	2	6	340	345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255072
4	NC_005838	CCCG	2	8	402	409	0 %	0 %	25 %	75 %	46255072
5	NC_005838	CCT	2	6	426	431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255072
6	NC_005838	GGC	2	6	441	446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255072
7	NC_005838	CCA	2	6	606	611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255072
8	NC_005838	GAA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255072
9	NC_005838	CCCA	2	8	629	636	25 %	0 %	0 %	75 %	46255072
10	NC_005838	C	6	6	661	666	0 %	0 %	0 %	100 %	46255072
11	NC_005838	GCG	2	6	694	699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255072
12	NC_005838	GCC	2	6	757	762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255072
13	NC_005838	GAG	3	9	766	774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255072
14	NC_005838	GTA	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255072
15	NC_005838	CCCGGG	2	12	903	914	0 %	0 %	50 %	50 %	46255072
16	NC_005838	G	6	6	926	931	0 %	0 %	100 %	0 %	46255072
17	NC_005838	GGCCT	2	10	938	947	0 %	20 %	40 %	40 %	46255072
18	NC_005838	GGGGC	2	10	954	963	0 %	0 %	80 %	20 %	46255072
19	NC_005838	GGC	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255072
20	NC_005838	GGA	2	6	978	983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255072
21	NC_005838	GGGGC	2	10	1026	1035	0 %	0 %	80 %	20 %	46255072
22	NC_005838	AGCC	2	8	1100	1107	25 %	0 %	25 %	50 %	46255072
23	NC_005838	CCT	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255072
24	NC_005838	CAC	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255072
25	NC_005838	G	6	6	1236	1241	0 %	0 %	100 %	0 %	46255072
26	NC_005838	CCA	3	9	1269	1277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255072
27	NC_005838	C	6	6	1389	1394	0 %	0 %	0 %	100 %	46255072
28	NC_005838	GAG	2	6	1417	1422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255072
29	NC_005838	GAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255072
30	NC_005838	CCT	2	6	1462	1467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255072
31	NC_005838	GGC	3	9	1468	1476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255072
32	NC_005838	GGTG	2	8	1485	1492	0 %	25 %	75 %	0 %	46255072
33	NC_005838	GAG	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255072
34	NC_005838	G	6	6	1599	1604	0 %	0 %	100 %	0 %	46255072
35	NC_005838	GAG	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255072
36	NC_005838	CCCCG	2	10	1729	1738	0 %	0 %	20 %	80 %	46255073
37	NC_005838	CAC	3	9	1740	1748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255073
38	NC_005838	CTC	2	6	1788	1793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255073
39	NC_005838	ACC	2	6	1840	1845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255073
40	NC_005838	GAG	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255073
41	NC_005838	CCT	2	6	1871	1876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255073
42	NC_005838	GCCC	2	8	1879	1886	0 %	0 %	25 %	75 %	46255073
43	NC_005838	CCT	2	6	1892	1897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255073
44	NC_005838	GGC	2	6	1905	1910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255073
45	NC_005838	CTC	2	6	1930	1935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255073
46	NC_005838	AGG	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255073
47	NC_005838	GCGG	2	8	2004	2011	0 %	0 %	75 %	25 %	46255073
48	NC_005838	TAA	2	6	2021	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46255073
49	NC_005838	GGC	2	6	2082	2087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255073
50	NC_005838	TTCCC	2	10	2096	2105	0 %	40 %	0 %	60 %	46255073
51	NC_005838	CGC	2	6	2134	2139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255073
52	NC_005838	CTC	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255073
53	NC_005838	GAA	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255074
54	NC_005838	AAG	2	6	2236	2241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255074
55	NC_005838	ACC	2	6	2249	2254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255074
56	NC_005838	CCT	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255074
57	NC_005838	GTCTCC	2	12	2483	2494	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	46255074
58	NC_005838	GCC	2	6	2502	2507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255074
59	NC_005838	CCT	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255074
60	NC_005838	CTC	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255074
61	NC_005838	GAGG	2	8	2679	2686	25 %	0 %	75 %	0 %	46255074
62	NC_005838	GGT	2	6	2695	2700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255074
63	NC_005838	CCA	2	6	2703	2708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255074
64	NC_005838	AGG	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255074
65	NC_005838	AGGA	2	8	2785	2792	50 %	0 %	50 %	0 %	46255075
66	NC_005838	AGG	3	9	2817	2825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
67	NC_005838	ACC	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255075
68	NC_005838	C	6	6	2873	2878	0 %	0 %	0 %	100 %	46255075
69	NC_005838	CAGGC	2	10	2889	2898	20 %	0 %	40 %	40 %	46255075
70	NC_005838	C	6	6	2905	2910	0 %	0 %	0 %	100 %	46255075
71	NC_005838	GGC	2	6	2912	2917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255075
72	NC_005838	GAG	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
73	NC_005838	GAG	2	6	2927	2932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
74	NC_005838	AGG	3	9	2949	2957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
75	NC_005838	AGGGC	2	10	2959	2968	20 %	0 %	60 %	20 %	46255075
76	NC_005838	AGG	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
77	NC_005838	AGGGCC	2	12	2983	2994	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255075
78	NC_005838	C	8	8	2993	3000	0 %	0 %	0 %	100 %	46255075
79	NC_005838	GGC	2	6	3008	3013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255075
80	NC_005838	GGA	2	6	3043	3048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
81	NC_005838	GGA	2	6	3052	3057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
82	NC_005838	AGG	3	9	3084	3092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
83	NC_005838	CCAGGG	2	12	3109	3120	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255075
84	NC_005838	AGG	4	12	3129	3140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
85	NC_005838	C	8	8	3145	3152	0 %	0 %	0 %	100 %	46255075
86	NC_005838	CGAAGG	2	12	3157	3168	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46255075
87	NC_005838	CTC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255075
88	NC_005838	GAG	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
89	NC_005838	GAG	3	9	3281	3289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
90	NC_005838	GCG	2	6	3303	3308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255075
91	NC_005838	G	6	6	3318	3323	0 %	0 %	100 %	0 %	46255075
92	NC_005838	GAG	2	6	3338	3343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
93	NC_005838	AGG	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
94	NC_005838	GAA	2	6	3380	3385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255075
95	NC_005838	TCC	3	9	3405	3413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255075
96	NC_005838	GAG	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255075
97	NC_005838	CCT	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255076
98	NC_005838	GGA	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255076
99	NC_005838	TCCCC	2	10	3567	3576	0 %	20 %	0 %	80 %	46255076
100	NC_005838	AGGTCC	2	12	3584	3595	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46255076
101	NC_005838	TGG	2	6	3626	3631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255076
102	NC_005838	GGT	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255076
103	NC_005838	C	7	7	3802	3808	0 %	0 %	0 %	100 %	46255076
104	NC_005838	GCC	2	6	3815	3820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255076
105	NC_005838	GGCG	2	8	3849	3856	0 %	0 %	75 %	25 %	46255076
106	NC_005838	CTC	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255076
107	NC_005838	CAC	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255076
108	NC_005838	GGGA	2	8	3934	3941	25 %	0 %	75 %	0 %	46255076
109	NC_005838	GCG	2	6	3953	3958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255076
110	NC_005838	GCC	3	9	3968	3976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255076
111	NC_005838	GTG	2	6	3977	3982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255076
112	NC_005838	CGG	2	6	4002	4007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255076
113	NC_005838	GAG	2	6	4009	4014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255076
114	NC_005838	CGC	2	6	4042	4047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255076
115	NC_005838	AGG	2	6	4061	4066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255076
116	NC_005838	CCT	2	6	4077	4082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255076
117	NC_005838	GGT	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255076
118	NC_005838	CAC	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255076
119	NC_005838	CCG	2	6	4206	4211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255076
120	NC_005838	GGC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255076
121	NC_005838	CCT	2	6	4275	4280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255076
122	NC_005838	CCA	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255076
123	NC_005838	CGG	3	9	4320	4328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255076
124	NC_005838	CCA	3	9	4329	4337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255076
125	NC_005838	C	6	6	4341	4346	0 %	0 %	0 %	100 %	46255076
126	NC_005838	GCG	2	6	4379	4384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255076
127	NC_005838	CCT	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255076
128	NC_005838	G	7	7	4422	4428	0 %	0 %	100 %	0 %	46255076
129	NC_005838	CCA	2	6	4479	4484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255076
130	NC_005838	GGGA	2	8	4552	4559	25 %	0 %	75 %	0 %	46255077
131	NC_005838	GGAC	2	8	4573	4580	25 %	0 %	50 %	25 %	46255077
132	NC_005838	CGG	2	6	4591	4596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255077
133	NC_005838	CTTC	2	8	4632	4639	0 %	50 %	0 %	50 %	46255077
134	NC_005838	CCT	2	6	4661	4666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255077
135	NC_005838	CGG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255077
136	NC_005838	C	6	6	4702	4707	0 %	0 %	0 %	100 %	46255077
137	NC_005838	AGG	2	6	4786	4791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255077
138	NC_005838	CCT	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255077
139	NC_005838	C	6	6	4817	4822	0 %	0 %	0 %	100 %	46255077
140	NC_005838	G	7	7	4908	4914	0 %	0 %	100 %	0 %	46255077
141	NC_005838	GCGG	2	8	4919	4926	0 %	0 %	75 %	25 %	46255077
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271	NC_005838	G	6	6	9236	9241	0 %	0 %	100 %	0 %	46255082
272	NC_005838	CCT	2	6	9262	9267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255082
273	NC_005838	CCT	2	6	9286	9291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255082
274	NC_005838	CCA	2	6	9340	9345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255082
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276	NC_005838	CCT	2	6	9361	9366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255082
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284	NC_005838	G	6	6	9661	9666	0 %	0 %	100 %	0 %	46255083
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310	NC_005838	GGA	2	6	10735	10740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255084
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392	NC_005838	GGT	2	6	13315	13320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255086
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403	NC_005838	GGA	2	6	13609	13614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255087
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405	NC_005838	GAG	2	6	13768	13773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255087
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